Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Homez-201ENSMUST00000081162 5609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Impg1-202ENSMUST00000113250 2965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r176-207ENSMUST00000228793 2959 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Zfp568-202ENSMUST00000146074 6867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Med23-202ENSMUST00000092646 5098 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Itih4-202ENSMUST00000078490 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Dlgap5-208ENSMUST00000180299 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gnb1-208ENSMUST00000176637 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Shprh-202ENSMUST00000054814 7225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Slc39a12-201ENSMUST00000082290 2675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm42969-201ENSMUST00000199858 3631 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Olfr121-202ENSMUST00000174675 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm32717-201ENSMUST00000219147 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm32802-201ENSMUST00000219565 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Sema3d-205ENSMUST00000197927 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Morc1-201ENSMUST00000023330 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Serpinb6b-202ENSMUST00000110293 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r79-202ENSMUST00000226953 5636 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm24257-201ENSMUST00000104472 131 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Pilrb1-201ENSMUST00000110978 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm8688-201ENSMUST00000118240 969 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm15158-201ENSMUST00000120577 570 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm16174-201ENSMUST00000137373 402 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Crem-229ENSMUST00000151084 957 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm24011-201ENSMUST00000157732 268 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Krtap22-2-201ENSMUST00000178913 380 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 5830468F06Rik-201ENSMUST00000184288 1104 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm5696-201ENSMUST00000189850 552 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm29562-201ENSMUST00000190113 904 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm38078-201ENSMUST00000192771 392 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm18752-201ENSMUST00000192876 608 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm10522-201ENSMUST00000194503 1163 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm43160-201ENSMUST00000196453 421 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm30835-201ENSMUST00000198825 689 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm18781-201ENSMUST00000211252 924 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 4933407I05Rik-201ENSMUST00000213311 482 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 4933407I05Rik-202ENSMUST00000213467 420 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 AC166361.1-201ENSMUST00000218567 403 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm9231-201ENSMUST00000220817 1009 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 AC154816.1-201ENSMUST00000222688 634 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gzma-202ENSMUST00000224282 996 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 AC154767.1-201ENSMUST00000224669 358 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r34-207ENSMUST00000228647 2979 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 AC154627.1-201ENSMUST00000228799 1286 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 1700018F24Rik-201ENSMUST00000031624 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Ndufa4-201ENSMUST00000031637 468 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Alpk2-201ENSMUST00000035548 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Mettl21c-201ENSMUST00000061421 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Tas2r144-201ENSMUST00000063489 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Rps6-ps2-201ENSMUST00000079841 747 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Fxyd5-201ENSMUST00000009831 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Msantd4-202ENSMUST00000212075 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm38257-201ENSMUST00000195881 2761 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1241-202ENSMUST00000214743 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm42678-201ENSMUST00000197163 2221 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1226-205ENSMUST00000216445 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Olfr338-201ENSMUST00000072114 5780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 F830016B08Rik-201ENSMUST00000171297 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Zfp964-201ENSMUST00000169125 1416 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm45832-201ENSMUST00000212762 1443 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 9230106D20Rik-201ENSMUST00000052806 1406 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm44704-201ENSMUST00000208963 1990 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Pla2g4c-ps-201ENSMUST00000204668 1364 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Mylk4-201ENSMUST00000057428 5571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Mettl6-201ENSMUST00000055303 3946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Tgtp1-201ENSMUST00000068063 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm10826-201ENSMUST00000215366 3304 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm14419-201ENSMUST00000108975 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm14435-201ENSMUST00000108995 643 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm5752-201ENSMUST00000117771 594 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm11225-201ENSMUST00000118903 1049 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm5255-201ENSMUST00000120125 642 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm6292-201ENSMUST00000120712 1095 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Rps8-ps3-201ENSMUST00000121011 650 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm14749-201ENSMUST00000121269 333 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm12464-201ENSMUST00000121385 1016 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm25319-201ENSMUST00000122552 325 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Apoc2-203ENSMUST00000142352 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm15086-201ENSMUST00000143110 573 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Kcnd3os-202ENSMUST00000143893 718 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm15100-201ENSMUST00000180357 573 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm27008-202ENSMUST00000182414 604 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 C430002N11Rik-204ENSMUST00000190054 443 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm36935-201ENSMUST00000192526 292 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 4930597L12Rik-201ENSMUST00000196286 911 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm9710-201ENSMUST00000198053 499 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm36816-201ENSMUST00000204824 493 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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