Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Gm21848-201ENSMUST00000187722 696 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm29623-201ENSMUST00000188316 696 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 2810407A14Rik-202ENSMUST00000189929 2172 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm21841-201ENSMUST00000189958 696 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm21757-201ENSMUST00000191075 696 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm28946-201ENSMUST00000191176 696 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm5256-201ENSMUST00000191412 877 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm37247-201ENSMUST00000192549 730 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm38328-201ENSMUST00000195582 317 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm38184-201ENSMUST00000195757 113 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Zc2hc1b-201ENSMUST00000019954 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Lrrc43Q3V0L5 Tmem147-206ENSMUST00000208169 537 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Lrrc43Q3V0L5 Slc14a2-201ENSMUST00000025434 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Lrrc43Q3V0L5 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Olfr124-201ENSMUST00000053599 1122 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Lrrc43Q3V0L5 Mefv-201ENSMUST00000023180 3126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Sipa1l2-201ENSMUST00000108775 6365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Epn2-204ENSMUST00000108713 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm19335-201ENSMUST00000195836 2069 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Ctf2-201ENSMUST00000076091 1754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Spry4-201ENSMUST00000025295 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Dusp16-202ENSMUST00000129433 3993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Lrrc43Q3V0L5 Snx25-207ENSMUST00000170416 3067 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Lrrc43Q3V0L5 Gabpb1-201ENSMUST00000039978 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Zc3h10-201ENSMUST00000040572 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Lrrc43Q3V0L5 Gm4640-201ENSMUST00000203927 2352 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Lrrc43Q3V0L5 Clec4a1-201ENSMUST00000060484 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Lrrc43Q3V0L5 Atp5k-201ENSMUST00000049628 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 5330417H12Rik-201ENSMUST00000060348 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm21541-201ENSMUST00000098128 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Olfr572-201ENSMUST00000098214 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Vti1a-202ENSMUST00000223690 4175 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Sec14l3-201ENSMUST00000068322 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Zscan18-205ENSMUST00000211392 3709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Asb14-203ENSMUST00000165929 1817 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Dysf-204ENSMUST00000113821 6803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
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