Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Gm32089-201ENSMUST00000221222 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 AC167977.1-201ENSMUST00000221384 234 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 AC122251.1-201ENSMUST00000227717 639 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Rps26-201ENSMUST00000026420 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Fam166a-201ENSMUST00000028346 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Prr32-201ENSMUST00000040002 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Olfr735-201ENSMUST00000049729 1065 ntAPPRIS P2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Olfr685-201ENSMUST00000051355 1088 ntAPPRIS P2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Lkaaear1-201ENSMUST00000052416 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm6028-201ENSMUST00000077111 574 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Tonsl-201ENSMUST00000078803 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Mucl1-201ENSMUST00000078842 621 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Tcl1b1-201ENSMUST00000085043 1040 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Nms-201ENSMUST00000088029 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Olfr1278-201ENSMUST00000090330 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 AI182371-206ENSMUST00000226631 1680 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Chn2-202ENSMUST00000067741 2983 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Sim1-201ENSMUST00000020071 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Cyld-205ENSMUST00000209532 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Krba1-204ENSMUST00000114572 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Cd209c-201ENSMUST00000044060 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Prkcz-202ENSMUST00000103178 4083 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Adam9-201ENSMUST00000084032 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 AC134869.1-201ENSMUST00000225230 2354 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Kcnab2-205ENSMUST00000159840 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Ntf3-203ENSMUST00000204542 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm44850-201ENSMUST00000205621 1329 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Fgg-202ENSMUST00000194175 1741 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 4930554H23Rik-201ENSMUST00000181327 2542 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Patj-202ENSMUST00000041284 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Dnah9-201ENSMUST00000080665 13798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Pde4b-205ENSMUST00000106904 2430 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Yme1l1-201ENSMUST00000028117 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Supt5-201ENSMUST00000003527 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Med23-201ENSMUST00000020159 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Pla2g2c-202ENSMUST00000105808 3448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Pms2-202ENSMUST00000110709 1386 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Mtfr1-203ENSMUST00000119865 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm13310-201ENSMUST00000120962 1381 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Fer-201ENSMUST00000000129 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 1700091H14Rik-202ENSMUST00000185725 1388 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Pax4-201ENSMUST00000031718 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Prnd-204ENSMUST00000110172 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 AC123705.1-201ENSMUST00000222512 2058 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Dlc1-206ENSMUST00000163663 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Fam35a-201ENSMUST00000111917 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Rnase4-201ENSMUST00000022428 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Ap3b1-201ENSMUST00000022196 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm10696-201ENSMUST00000161475 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 4933433G08Rik-201ENSMUST00000217392 1845 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Trim21-202ENSMUST00000106913 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Ighv2-4-201ENSMUST00000103447 350 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm2348-201ENSMUST00000108782 300 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm9126-201ENSMUST00000117072 416 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm13925-201ENSMUST00000117315 243 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm12038-201ENSMUST00000117322 207 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm15504-201ENSMUST00000119674 265 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm14514-201ENSMUST00000121680 940 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm13904-201ENSMUST00000121901 837 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm4908-201ENSMUST00000121923 1005 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 n-R5s76-201ENSMUST00000122700 113 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm13049-201ENSMUST00000133196 757 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm25455-201ENSMUST00000157946 325 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm24363-201ENSMUST00000158440 311 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm23025-201ENSMUST00000158769 111 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm23703-201ENSMUST00000158839 143 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm16585-201ENSMUST00000161442 610 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm5093-201ENSMUST00000166852 522 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm6647-201ENSMUST00000170514 641 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm8893-201ENSMUST00000172146 1242 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm20447-201ENSMUST00000173290 599 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm23403-201ENSMUST00000179169 110 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm29460-201ENSMUST00000188607 714 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm28956-201ENSMUST00000189047 427 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm38063-201ENSMUST00000193990 342 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm1647-201ENSMUST00000195406 735 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm17978-201ENSMUST00000195986 769 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Rpl7a-ps7-201ENSMUST00000198361 776 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm36548-202ENSMUST00000200222 494 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm26911-202ENSMUST00000204244 763 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm5001-201ENSMUST00000204361 331 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Ghrl-207ENSMUST00000204533 323 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Klk1b10-ps-201ENSMUST00000205895 783 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 4930598N05Rik-204ENSMUST00000207733 675 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Smarca2-238ENSMUST00000208589 1054 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm45842-201ENSMUST00000211876 753 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm36368-201ENSMUST00000212026 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 CT485606.3-201ENSMUST00000215810 624 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm5183-201ENSMUST00000219409 629 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 AC111044.1-201ENSMUST00000220206 555 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 AC155269.1-201ENSMUST00000220843 769 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm19011-201ENSMUST00000221777 808 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 AC154747.2-201ENSMUST00000225109 780 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gkn1-201ENSMUST00000032129 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Taar6-201ENSMUST00000057080 1038 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Ghrl-201ENSMUST00000064993 527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Olfr1373-201ENSMUST00000078264 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Skint11-201ENSMUST00000079915 820 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Olfr1351-201ENSMUST00000080730 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Sval3-201ENSMUST00000080742 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms