Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Rps6ka6-201ENSMUST00000065976 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Baz2a-208ENSMUST00000220049 8443 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Mstn-201ENSMUST00000027269 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Ndufb8-209ENSMUST00000171415 2142 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm40893-201ENSMUST00000220507 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 AC133598.5-201ENSMUST00000224937 1517 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Iqch-206ENSMUST00000171243 3099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Wdr35-202ENSMUST00000111113 4312 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Asph-209ENSMUST00000108335 2514 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Vmn1r-ps123-201ENSMUST00000110449 237 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Fate1-202ENSMUST00000114569 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Rpl35a-203ENSMUST00000115076 519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm16113-201ENSMUST00000159629 372 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm6428-201ENSMUST00000161062 345 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Ms4a2-202ENSMUST00000164792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Svs6-201ENSMUST00000017144 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm5261-201ENSMUST00000185860 713 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Ms4a2-205ENSMUST00000189641 647 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm42813-201ENSMUST00000200057 615 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 5033423K11Rik-202ENSMUST00000202802 1162 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Olfr1486-ps1-201ENSMUST00000208835 220 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm45900-201ENSMUST00000211879 409 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 AC115304.1-202ENSMUST00000226850 837 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Ms4a2-201ENSMUST00000025583 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Fate1-201ENSMUST00000066116 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Olfr1076-201ENSMUST00000076263 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Olfr1259-201ENSMUST00000090695 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Rdh16-201ENSMUST00000071646 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm26813-201ENSMUST00000180778 3587 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Sox6-206ENSMUST00000205405 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Cbll1-202ENSMUST00000085487 1332 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Il18bp-201ENSMUST00000094134 1311 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Pum1-205ENSMUST00000105992 5058 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 AC166574.5-201ENSMUST00000227438 1432 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Tma16-201ENSMUST00000026681 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Tmem43-201ENSMUST00000032183 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Clec1a-202ENSMUST00000203162 5128 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 BB031773-201ENSMUST00000148892 3655 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Zfp667-201ENSMUST00000086327 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Tgm3-201ENSMUST00000110299 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Wdfy4-202ENSMUST00000130509 10158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Ep400-204ENSMUST00000112436 10685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm28651-202ENSMUST00000227968 2693 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Nebl-201ENSMUST00000028080 5780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Rnf43-209ENSMUST00000165679 4310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Taok3-210ENSMUST00000179276 4302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Med23-201ENSMUST00000020159 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm10637-202ENSMUST00000184702 3233 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm7134-201ENSMUST00000122296 2406 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm21056-201ENSMUST00000221636 4635 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm12844-201ENSMUST00000119463 582 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Vamp7-ps-201ENSMUST00000120334 655 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm5392-201ENSMUST00000122189 789 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm11267-201ENSMUST00000137477 1071 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm15736-201ENSMUST00000141710 420 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm16110-201ENSMUST00000161473 892 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm2619-202ENSMUST00000166777 651 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Sh3bgr-207ENSMUST00000171181 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Prl3c1-203ENSMUST00000178072 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Mir6241-201ENSMUST00000184225 103 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm28416-201ENSMUST00000188334 292 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Lax1-202ENSMUST00000189524 628 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm38254-201ENSMUST00000192276 1009 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm19030-201ENSMUST00000194947 552 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm44508-201ENSMUST00000206943 1157 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm35021-202ENSMUST00000210289 961 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm45345-201ENSMUST00000211427 555 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 AC161250.1-201ENSMUST00000213426 1111 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 AC153532.1-201ENSMUST00000218126 1111 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 AC160105.1-201ENSMUST00000221931 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 AV026068-219ENSMUST00000224148 933 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 AC133598.3-204ENSMUST00000224260 767 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 AC161275.1-201ENSMUST00000224668 208 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 CT009527.2-201ENSMUST00000225386 606 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 AC122309.1-201ENSMUST00000226945 421 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Olfr1361-201ENSMUST00000055615 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Trim40-201ENSMUST00000087158 2117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Olfr1275-201ENSMUST00000099620 1020 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Depdc5-205ENSMUST00000120902 5195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Csnk1d-202ENSMUST00000070575 3500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Dmxl2-201ENSMUST00000118163 10614 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm45017-201ENSMUST00000206842 1777 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Wdfy3-205ENSMUST00000174598 10581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Mcmdc2-201ENSMUST00000052843 2826 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 AC121286.2-201ENSMUST00000218069 2470 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm15903-202ENSMUST00000199631 3518 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Unc5c-204ENSMUST00000130636 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Glod4-206ENSMUST00000169701 4203 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm8728-201ENSMUST00000207367 2178 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm8486-201ENSMUST00000207508 2171 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm8685-201ENSMUST00000207567 2183 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm16443-201ENSMUST00000207909 2184 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 4930553P18Rik-201ENSMUST00000201164 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Ptprr-202ENSMUST00000105271 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gm37995-201ENSMUST00000194958 1714 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Slc3a1-201ENSMUST00000024944 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Gsdmc-202ENSMUST00000173503 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Atp7a-202ENSMUST00000113557 4900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Puf60Q3UEB3 Nfkbiz-203ENSMUST00000114457 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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