Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Tmem167-203ENSMUST00000161568 8689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm4961-201ENSMUST00000197982 2249 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Slc6a18-202ENSMUST00000109679 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Ulk4-209ENSMUST00000171923 4103 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Frmd7-201ENSMUST00000060650 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Rxfp1-201ENSMUST00000078527 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm42771-201ENSMUST00000198342 2486 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Olfr43-202ENSMUST00000205664 2018 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Phf3-205ENSMUST00000186733 7567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 AC159002.2-201ENSMUST00000228843 4874 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm28547-201ENSMUST00000186357 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 A630009H07Rik-201ENSMUST00000208485 2159 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 AC153945.1-201ENSMUST00000217761 1722 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Celf2-214ENSMUST00000170438 8856 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Homer1-209ENSMUST00000109496 772 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm5228-201ENSMUST00000117186 357 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm11474-201ENSMUST00000120814 277 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm12535-201ENSMUST00000121025 484 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm14612-201ENSMUST00000121522 881 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Amy2-ps1-201ENSMUST00000122117 1117 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Halr1-201ENSMUST00000125374 391 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Bloodlinc-201ENSMUST00000126237 679 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm2788-201ENSMUST00000129551 797 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm15092-201ENSMUST00000138467 574 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 9630013K17Rik-201ENSMUST00000146915 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm11697-201ENSMUST00000149226 525 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm15392-201ENSMUST00000152863 778 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm23007-201ENSMUST00000158951 177 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Mgst2-206ENSMUST00000161590 481 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm26505-201ENSMUST00000176208 166 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm21182-201ENSMUST00000178899 794 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm18875-201ENSMUST00000188563 882 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm18352-201ENSMUST00000189113 902 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 2010103J01Rik-201ENSMUST00000192375 388 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Ighv1-73-201ENSMUST00000197435 352 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Shisa5-207ENSMUST00000197483 534 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm43235-201ENSMUST00000200121 297 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm9419-201ENSMUST00000200672 567 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm45900-201ENSMUST00000211879 409 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm29154-253ENSMUST00000217229 1207 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 4930550C14Rik-204ENSMUST00000217318 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm8275-201ENSMUST00000219732 424 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm7712-201ENSMUST00000222214 337 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm34639-202ENSMUST00000223473 649 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 AL837512.1-201ENSMUST00000223914 1073 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 AC069562.1-201ENSMUST00000224206 434 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 AC131117.2-202ENSMUST00000224539 547 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Nsun7-201ENSMUST00000031109 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm21043-201ENSMUST00000199316 1517 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Adcy10-203ENSMUST00000111440 5078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Cd209b-201ENSMUST00000084086 2039 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Msn-201ENSMUST00000117399 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Odf2l-203ENSMUST00000098539 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Trpm7-201ENSMUST00000028843 6985 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm11758-202ENSMUST00000107327 1325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Clcn7-204ENSMUST00000160961 3983 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm43970-201ENSMUST00000204346 3605 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm45470-201ENSMUST00000209685 7044 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Zfp207-202ENSMUST00000053740 1562 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm10424-202ENSMUST00000201031 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 CT025535.2-201ENSMUST00000228572 7441 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Phactr2-204ENSMUST00000105546 2808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Hps5-203ENSMUST00000107654 4422 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm26545-201ENSMUST00000181082 1746 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gabpb2-202ENSMUST00000098873 8272 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Dopey1-218ENSMUST00000190957 9187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 C2cd3-201ENSMUST00000051777 7803 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm16072-201ENSMUST00000119574 2377 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Olfr622-204ENSMUST00000216570 2149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Cntn4-206ENSMUST00000113264 5262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Mef2c-222ENSMUST00000199019 4441 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm10401-201ENSMUST00000100848 607 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Olfr1293-ps-201ENSMUST00000102551 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Selenof-202ENSMUST00000106211 1178 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm14279-201ENSMUST00000117142 332 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Rpl35a-ps2-201ENSMUST00000117444 333 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm10243-201ENSMUST00000117571 333 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm11880-201ENSMUST00000117612 399 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm7571-201ENSMUST00000120252 927 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Rpl35a-ps4-201ENSMUST00000121779 333 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Olfr999-ps1-201ENSMUST00000122319 949 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Rpl35a-ps3-201ENSMUST00000147311 333 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Rpl35a-ps6-201ENSMUST00000148282 333 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Acss2os-201ENSMUST00000148685 629 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 9130230L23Rik-201ENSMUST00000165250 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Obox4-ps31-201ENSMUST00000177210 1137 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm21839-201ENSMUST00000179536 378 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm7481-201ENSMUST00000182020 995 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm27185-201ENSMUST00000184296 247 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Ly6g-202ENSMUST00000190262 941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm18797-201ENSMUST00000190809 1174 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm30735-201ENSMUST00000199488 726 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Ube2n-ps1-201ENSMUST00000201768 459 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 AC122539.1-201ENSMUST00000219925 329 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 AC157212.1-201ENSMUST00000228398 1075 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm10123-201ENSMUST00000075723 490 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm10247-201ENSMUST00000090395 333 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Zc3h11a-201ENSMUST00000027736 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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