Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Mir7230-201ENSMUST00000195977 56 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm44427-201ENSMUST00000204123 456 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Olfr1295-201ENSMUST00000207283 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm9354-201ENSMUST00000209075 468 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm6909-201ENSMUST00000209825 989 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm7239-201ENSMUST00000220981 860 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 4930556J24Rik-201ENSMUST00000042344 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Arhgef38-201ENSMUST00000054105 814 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 6030452D12Rik-201ENSMUST00000066875 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Tdgf1-ps2-201ENSMUST00000074412 505 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm4956-201ENSMUST00000082032 1148 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Dmrtc1c2-202ENSMUST00000087899 717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Glra4-201ENSMUST00000018739 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Vmn2r87-201ENSMUST00000164227 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Slitrk4-201ENSMUST00000069926 8494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gprasp1-202ENSMUST00000113145 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Specc1-203ENSMUST00000108709 6843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm38026-201ENSMUST00000193284 3880 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Adgrf1-201ENSMUST00000047399 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Dgkb-201ENSMUST00000040500 6373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 A230028O05Rik-201ENSMUST00000181655 2793 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm15448-201ENSMUST00000094911 1557 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Abca4-207ENSMUST00000141135 3606 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Cd200r4-203ENSMUST00000176819 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Lrrcc1-206ENSMUST00000169079 5638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm45056-201ENSMUST00000208140 3462 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Usp17ld-201ENSMUST00000073394 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 1700015I17Rik-201ENSMUST00000209585 2099 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gfral-201ENSMUST00000074880 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Olfr1087-202ENSMUST00000214141 3861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 4930480K23Rik-201ENSMUST00000180465 3326 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm44667-201ENSMUST00000207632 3337 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Rab39b-201ENSMUST00000033545 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm21123-201ENSMUST00000210822 1734 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm3669-201ENSMUST00000126712 1846 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm2165-202ENSMUST00000129963 1846 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm2101-203ENSMUST00000133794 1846 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm2117-203ENSMUST00000147993 1846 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Kirrel3os-201ENSMUST00000066604 3799 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 AC122426.2-201ENSMUST00000216522 2947 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Sytl4-203ENSMUST00000113297 3306 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Olfr305-203ENSMUST00000213869 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
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Sh3bp1P55194 Pex3-203ENSMUST00000105541 1072 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
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Sh3bp1P55194 Gm15209-201ENSMUST00000117703 400 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
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Sh3bp1P55194 Gm11955-201ENSMUST00000119801 470 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Dnase1-202ENSMUST00000120009 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm15842-201ENSMUST00000120513 618 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm13586-201ENSMUST00000121784 464 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
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Sh3bp1P55194 Rpl29-203ENSMUST00000150576 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Ttc9c-204ENSMUST00000153281 1192 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
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Sh3bp1P55194 Trav9n-2-201ENSMUST00000180097 337 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
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Sh3bp1P55194 9330159M07Rik-204ENSMUST00000188156 737 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
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Sh3bp1P55194 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Arl9-201ENSMUST00000071199 402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Defa35-201ENSMUST00000078121 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
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Sh3bp1P55194 Nipsnap3a-202ENSMUST00000107666 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
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Sh3bp1P55194 Gm38244-201ENSMUST00000191737 2586 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Olfr1311-203ENSMUST00000215321 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Cep290-210ENSMUST00000220346 8211 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Masp2-201ENSMUST00000052060 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Ctps2-201ENSMUST00000033727 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Dennd2c-204ENSMUST00000173206 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Fhl4-201ENSMUST00000059383 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Tlr1-202ENSMUST00000197315 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Adgrl2-202ENSMUST00000106128 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Olfr45-202ENSMUST00000214637 6157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Mpzl3-203ENSMUST00000114664 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Erc1-210ENSMUST00000184864 5428 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm37703-201ENSMUST00000192292 1784 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm45470-201ENSMUST00000209685 7044 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Tmem236-201ENSMUST00000077517 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
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