Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gm9497-201ENSMUST00000199908 538 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 4933432K03Rik-201ENSMUST00000205739 1247 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Olfr1348-204ENSMUST00000208066 1135 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Gm19170-201ENSMUST00000212440 1084 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 4930401A07Rik-202ENSMUST00000216155 360 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Gm46124-202ENSMUST00000217260 860 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 AC116589.3-202ENSMUST00000221770 649 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 CT009718.2-202ENSMUST00000222092 704 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 AC116589.6-201ENSMUST00000222252 649 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 AC153152.2-201ENSMUST00000223165 959 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 AC154724.1-201ENSMUST00000225782 821 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 CT009556.3-201ENSMUST00000226173 513 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Prl2a1-201ENSMUST00000023602 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Defb3-201ENSMUST00000033852 275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Defb34-201ENSMUST00000064475 246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Timp1-201ENSMUST00000009530 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Klrk1-202ENSMUST00000095412 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Rnf19a-203ENSMUST00000228358 3452 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Gm43162-201ENSMUST00000198292 1770 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 3110035E14Rik-201ENSMUST00000088666 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Olfr1055-203ENSMUST00000213564 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Lipf-201ENSMUST00000025680 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Dppa2-201ENSMUST00000097175 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Acsl1-203ENSMUST00000110372 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Zp2-205ENSMUST00000208874 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Serpina3a-203ENSMUST00000185595 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Nolc1-203ENSMUST00000223728 3523 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Gm8798-202ENSMUST00000213048 2357 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Mtfr1-202ENSMUST00000117529 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Ccdc187-203ENSMUST00000227200 9528 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Zc2hc1c-201ENSMUST00000059341 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Nedd4-209ENSMUST00000184450 3329 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Gm28839-201ENSMUST00000189579 2171 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 BC030870-201ENSMUST00000098713 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Acvr1-202ENSMUST00000090935 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Gm7648-201ENSMUST00000173036 1658 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Sidt1-204ENSMUST00000127567 2901 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Olfr1360-202ENSMUST00000205788 1988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Gm37326-201ENSMUST00000192828 3071 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Gm38263-201ENSMUST00000195879 3059 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Myo1e-201ENSMUST00000034745 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Grik1-202ENSMUST00000072256 3655 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 AC168056.4-201ENSMUST00000223835 2567 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 AC061963.2-201ENSMUST00000213541 2739 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Gm38414-201ENSMUST00000209819 1488 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Krt39-202ENSMUST00000107445 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Platr30-202ENSMUST00000199348 1934 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Gm5087-201ENSMUST00000060526 1921 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 AI429214-201ENSMUST00000098825 1930 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Map4k4-209ENSMUST00000192509 3918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 9530053A07Rik-201ENSMUST00000059886 7922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Antxrl-201ENSMUST00000058725 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Gm22660-201ENSMUST00000104193 130 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Kyat3-202ENSMUST00000106218 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Klra10-201ENSMUST00000112020 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Gm12344-201ENSMUST00000117087 329 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Gm14576-201ENSMUST00000118073 1111 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Gm12024-201ENSMUST00000118819 1253 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Gm12219-201ENSMUST00000119198 443 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Gm23429-201ENSMUST00000122486 149 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Gm15351-203ENSMUST00000153095 406 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Gm24738-201ENSMUST00000158856 123 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Rfx3-204ENSMUST00000172907 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Mthfr-ps1-201ENSMUST00000174153 601 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Sos2-203ENSMUST00000182396 3963 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Mir8099-2-201ENSMUST00000183568 127 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Mir6340-201ENSMUST00000183857 119 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Mir8099-1-201ENSMUST00000184238 127 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Gm28888-201ENSMUST00000186556 316 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Gm20813-201ENSMUST00000186646 705 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Gm28535-201ENSMUST00000188069 885 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Gm21923-201ENSMUST00000188455 696 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Gm28384-201ENSMUST00000189079 463 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Gm28427-201ENSMUST00000190144 2162 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Gm38072-201ENSMUST00000192127 2162 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Gm37543-201ENSMUST00000192443 1031 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 4933403L11Rik-201ENSMUST00000193857 1121 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Gm42558-201ENSMUST00000200982 265 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Gm18861-201ENSMUST00000202509 1186 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Olfr314-202ENSMUST00000205189 2647 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 AC153821.1-201ENSMUST00000217893 581 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 CT485612.1-201ENSMUST00000222555 382 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Platr25-208ENSMUST00000222602 939 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 AC139294.2-201ENSMUST00000227159 285 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 BC023105-201ENSMUST00000073997 1227 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Olfr224-201ENSMUST00000081102 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Tmem265-201ENSMUST00000084563 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Gm10801-201ENSMUST00000099684 504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Elmo2-205ENSMUST00000103091 4695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Gm37199-201ENSMUST00000193881 4065 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Elavl4-207ENSMUST00000106603 3761 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Bbs9-210ENSMUST00000147712 3495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Gm26512-201ENSMUST00000181874 3042 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Gm26939-201ENSMUST00000177146 2261 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Rps20-203ENSMUST00000138502 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Helz2-202ENSMUST00000108831 10109 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Olfr943-205ENSMUST00000215770 8308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Gm6185-202ENSMUST00000212885 2692 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Gsdmc-202ENSMUST00000173503 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Nedd1P33215 Trpv1-202ENSMUST00000102526 3361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms