Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Gm42577-201ENSMUST00000201367 3211 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 AC135083.2-201ENSMUST00000228599 1456 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Ctnna2-206ENSMUST00000162273 3277 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Arhgef12-201ENSMUST00000072767 10059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Pum2-216ENSMUST00000178015 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Rapgef4os3-201ENSMUST00000132792 3485 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Nsun4-202ENSMUST00000030475 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 8430437L04Rik-201ENSMUST00000124829 1663 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Pikfyve-201ENSMUST00000081154 11237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Pcdh15-227ENSMUST00000152655 3860 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Plekhh2-201ENSMUST00000047206 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Zc3h12b-201ENSMUST00000082183 2831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 A830010M20Rik-204ENSMUST00000112671 6756 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Igkv4-81-201ENSMUST00000103340 290 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Ccdc47-202ENSMUST00000106865 704 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Gm12789-201ENSMUST00000106914 883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Gm15062-201ENSMUST00000120567 367 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Gm12632-201ENSMUST00000121223 495 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Gm15096-201ENSMUST00000121918 878 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Rrm2b-207ENSMUST00000146821 420 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Gm15351-203ENSMUST00000153095 406 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Gm26408-201ENSMUST00000157672 127 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Gm25164-201ENSMUST00000158908 116 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Vmn2r-ps60-201ENSMUST00000173296 897 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Gm28645-201ENSMUST00000185859 564 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Gm18352-201ENSMUST00000189113 902 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Gm23011-202ENSMUST00000197855 275 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Gm42959-201ENSMUST00000202184 212 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 4930425L21Rik-201ENSMUST00000203439 899 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Gm44129-201ENSMUST00000203511 675 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Gm5154-201ENSMUST00000203971 399 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Gm45579-201ENSMUST00000209367 887 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Spaca7-203ENSMUST00000210276 715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Mrpl42-202ENSMUST00000217777 455 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Gm40421-201ENSMUST00000218991 658 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 AC137117.3-201ENSMUST00000226265 485 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 AC156574.1-201ENSMUST00000227084 452 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Pmis2-201ENSMUST00000051495 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Tas2r144-201ENSMUST00000063489 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Vmn1r195-201ENSMUST00000091736 1088 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Unc13b-216ENSMUST00000207708 6574 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Gm42820-201ENSMUST00000200084 3063 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 5430421F17Rik-202ENSMUST00000210268 2295 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 AC117232.2-201ENSMUST00000219469 2917 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Pigc-202ENSMUST00000111594 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Trim5-201ENSMUST00000051795 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Gm10439-201ENSMUST00000101181 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Olfr1351-202ENSMUST00000216030 2489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Gatad2b-203ENSMUST00000197988 1815 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Sestd1-202ENSMUST00000102660 8990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Tnfrsf22-201ENSMUST00000075588 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Grip1-208ENSMUST00000138410 3532 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Frs2-201ENSMUST00000020381 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 4930516K23Rik-201ENSMUST00000074064 6133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Tmem232-202ENSMUST00000086722 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 9630002D21Rik-201ENSMUST00000221128 1351 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Vmn1r58-204ENSMUST00000228728 9991 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Gm16427-202ENSMUST00000200745 1749 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Tdrd7-202ENSMUST00000107777 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 C2cd3-201ENSMUST00000051777 7803 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Gm7978-201ENSMUST00000178552 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Gm16429-201ENSMUST00000179824 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Spp1-201ENSMUST00000031243 1410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PrkcdP28867 Gm42996-201ENSMUST00000196116 1636 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PrkcdP28867 Gm43168-201ENSMUST00000201039 1612 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PrkcdP28867 Gm14864-201ENSMUST00000116164 1087 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PrkcdP28867 Gm26469-201ENSMUST00000116765 121 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PrkcdP28867 Gm7785-201ENSMUST00000117121 892 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PrkcdP28867 Gm16044-201ENSMUST00000118475 450 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PrkcdP28867 Gm16407-201ENSMUST00000122134 567 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PrkcdP28867 Ube2v1-207ENSMUST00000151365 924 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PrkcdP28867 Gm22811-201ENSMUST00000157468 154 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PrkcdP28867 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PrkcdP28867 Gm26436-201ENSMUST00000180325 132 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PrkcdP28867 Gm25947-201ENSMUST00000180343 110 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PrkcdP28867 Gm27218-201ENSMUST00000183745 392 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PrkcdP28867 Gm27542-201ENSMUST00000184184 256 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PrkcdP28867 Gm38047-201ENSMUST00000193690 1133 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PrkcdP28867 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PrkcdP28867 Gm31881-202ENSMUST00000199455 559 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PrkcdP28867 Gpr19-210ENSMUST00000203762 498 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PrkcdP28867 Fxyd4-208ENSMUST00000204950 586 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PrkcdP28867 Gm29977-201ENSMUST00000206804 724 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PrkcdP28867 Gm18562-201ENSMUST00000209949 915 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PrkcdP28867 AC121793.1-201ENSMUST00000214211 633 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PrkcdP28867 CT485606.3-201ENSMUST00000215810 624 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PrkcdP28867 Gm18112-201ENSMUST00000219862 1195 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PrkcdP28867 4933409F18Rik-201ENSMUST00000221910 1267 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PrkcdP28867 Gm4804-203ENSMUST00000222542 577 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PrkcdP28867 Gpihbp1-201ENSMUST00000023243 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PrkcdP28867 Gpr87-201ENSMUST00000056898 1080 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PrkcdP28867 Kcne4-202ENSMUST00000187432 1813 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PrkcdP28867 Pdlim5-205ENSMUST00000170361 2010 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms