Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 4930520K02Rik-201ENSMUST00000219522 388 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm45925-202ENSMUST00000219904 1136 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 1700040E09Rik-201ENSMUST00000222440 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm4804-203ENSMUST00000222542 577 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Hsd17b3-204ENSMUST00000222783 1184 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Smim15-203ENSMUST00000224361 830 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Trappc8-206ENSMUST00000225661 5191 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Olfr1255-201ENSMUST00000057369 933 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Olfr432-201ENSMUST00000062665 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm25926-201ENSMUST00000082899 160 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Smad5-202ENSMUST00000109874 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm43581-201ENSMUST00000196766 2864 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Olfr1106-202ENSMUST00000213781 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Olfr1106-203ENSMUST00000217650 2573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Olfr1494-202ENSMUST00000207836 2100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Ncapg-201ENSMUST00000117396 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm37163-201ENSMUST00000195439 1690 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Lmbrd2-204ENSMUST00000227556 8099 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm11853-201ENSMUST00000119687 1384 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Accs-203ENSMUST00000111246 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Ppp1r9a-212ENSMUST00000177456 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Fam193a-201ENSMUST00000094867 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Cdk14-202ENSMUST00000115450 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Pard3-220ENSMUST00000162456 3204 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Fbxw7-203ENSMUST00000107678 4073 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 4930594C11Rik-201ENSMUST00000192316 2755 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm42969-201ENSMUST00000199858 3631 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm29670-201ENSMUST00000190228 2491 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Taf1-201ENSMUST00000101341 8054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Ncald-204ENSMUST00000120746 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Ptpn22-201ENSMUST00000029433 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm8836-201ENSMUST00000198196 1348 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Ndrg3-202ENSMUST00000072298 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Cops2-202ENSMUST00000110462 1853 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Dock10-209ENSMUST00000190983 6672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Ikzf5-201ENSMUST00000046306 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 CT009718.2-201ENSMUST00000221408 1428 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm35208-201ENSMUST00000221590 1411 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Agbl1-202ENSMUST00000107442 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm43728-201ENSMUST00000198817 2622 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm43363-201ENSMUST00000201590 2647 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm22022-201ENSMUST00000104355 127 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm22150-201ENSMUST00000104447 135 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Trappc1-204ENSMUST00000108662 635 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm41-201ENSMUST00000116183 1023 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm15913-201ENSMUST00000118492 331 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm11945-201ENSMUST00000120551 476 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Bambi-ps1-201ENSMUST00000121525 592 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm15606-202ENSMUST00000139851 711 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm15351-203ENSMUST00000153095 406 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm24011-201ENSMUST00000157732 268 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm24530-201ENSMUST00000157948 288 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm25266-201ENSMUST00000158521 304 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm17129-201ENSMUST00000168168 505 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Vmn1r1-201ENSMUST00000169123 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm19840-201ENSMUST00000169624 882 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm4246-201ENSMUST00000172822 216 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm25692-201ENSMUST00000175444 125 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Scgb2b20-201ENSMUST00000179248 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 1700015G11Rik-201ENSMUST00000180038 397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm26652-201ENSMUST00000180592 373 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 9330179D12Rik-202ENSMUST00000180811 1001 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm7763-201ENSMUST00000182220 1006 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm28462-201ENSMUST00000185217 374 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Scgb2b18-201ENSMUST00000186529 523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm9745-202ENSMUST00000187196 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm7436-201ENSMUST00000187229 391 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Scgb2b11-201ENSMUST00000188293 523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm29003-202ENSMUST00000190434 453 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm18699-201ENSMUST00000190713 243 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm17970-201ENSMUST00000192199 685 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm16754-202ENSMUST00000193429 508 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Trbv9-201ENSMUST00000194494 290 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm42489-201ENSMUST00000198964 669 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm40319-201ENSMUST00000199785 481 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm43699-201ENSMUST00000201312 818 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Traf1-209ENSMUST00000201690 386 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Tex26-207ENSMUST00000202920 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm33778-201ENSMUST00000216884 704 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 AC165349.2-201ENSMUST00000219097 426 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 AC055772.1-201ENSMUST00000222646 395 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Tmem225-201ENSMUST00000046333 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Olfr600-201ENSMUST00000056222 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Tas2r134-201ENSMUST00000070028 898 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Olfr530-201ENSMUST00000074177 1080 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Ube2e2-201ENSMUST00000076133 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm10805-201ENSMUST00000099710 399 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Olfr1513-202ENSMUST00000215147 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Osbpl9-201ENSMUST00000030288 2871 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Nxpe4-203ENSMUST00000216998 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm17300-201ENSMUST00000172202 1527 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Psd4-210ENSMUST00000166388 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Klf8-202ENSMUST00000112574 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Ppfibp2-202ENSMUST00000098134 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm6101-201ENSMUST00000195384 1867 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Olfr97-205ENSMUST00000214848 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms