Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Gm28952-201ENSMUST00000189285 681 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 AC122428.4-201ENSMUST00000213494 589 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Odf3l1-202ENSMUST00000215694 1212 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 AC133948.2-201ENSMUST00000217850 378 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 AC157212.1-201ENSMUST00000228398 1075 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Mgst1-201ENSMUST00000008684 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 AC124572.1-201ENSMUST00000218155 2406 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 5031434C07Rik-202ENSMUST00000188014 3244 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Gm30698-201ENSMUST00000214789 3198 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Gm43019-201ENSMUST00000196948 2863 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Pcm1-201ENSMUST00000045218 6624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Eif2ak4-206ENSMUST00000110874 5298 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Ccdc180-204ENSMUST00000178561 5081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Pole2-202ENSMUST00000221411 1641 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Mapre2-209ENSMUST00000170802 3936 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Serbp1-201ENSMUST00000042990 15474 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Gm37420-201ENSMUST00000195332 2912 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Trrap-215ENSMUST00000213013 12398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Gm29025-201ENSMUST00000186756 2163 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Pcyt1b-202ENSMUST00000113933 4867 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Pcyt1b-201ENSMUST00000045898 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Cd84-203ENSMUST00000135386 3434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Olfr1157-201ENSMUST00000099841 4621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Bdnf-203ENSMUST00000111043 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 1700025D23Rik-201ENSMUST00000129365 846 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Obox3-ps3-201ENSMUST00000177242 1004 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Peak1os-201ENSMUST00000181444 1264 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Gm43725-201ENSMUST00000200122 369 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Ccl24-202ENSMUST00000201401 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Gm45042-201ENSMUST00000207377 211 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Tgm4-206ENSMUST00000215247 951 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Gm19007-201ENSMUST00000217746 874 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 AC157572.1-201ENSMUST00000227187 825 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Bglap3-201ENSMUST00000075523 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Gm12295-201ENSMUST00000128453 3189 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Gm3234-201ENSMUST00000222644 5061 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Gon4l-201ENSMUST00000081695 7440 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Gon4l-202ENSMUST00000090942 7443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Zfp652-202ENSMUST00000107717 10433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Polq-201ENSMUST00000054034 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Gm12021-201ENSMUST00000121061 1746 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Krr1-203ENSMUST00000163048 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Pde10a-204ENSMUST00000115715 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Rnf219-202ENSMUST00000227640 1632 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Rtel1-203ENSMUST00000098971 4307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Ints9-201ENSMUST00000043914 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Zfp507-201ENSMUST00000061586 6693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Polr1a-201ENSMUST00000055296 9216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 1700007E05Rik-201ENSMUST00000186196 1513 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Gm20045-201ENSMUST00000192658 5577 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Ctnnd1-211ENSMUST00000111685 5985 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Ctnnd1-215ENSMUST00000111689 5961 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Olfr523-206ENSMUST00000216023 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Ryr1-201ENSMUST00000032813 15352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Gm44652-201ENSMUST00000208648 2854 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Cep55-202ENSMUST00000116506 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Frmd4a-219ENSMUST00000177457 6538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Gm42577-201ENSMUST00000201367 3211 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Olfr554-202ENSMUST00000214841 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Rhox4g-201ENSMUST00000115166 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Rhox4a2-201ENSMUST00000179915 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Sbp-202ENSMUST00000181985 920 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Gm7481-201ENSMUST00000182020 995 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Gm27001-201ENSMUST00000182252 936 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Gm9745-202ENSMUST00000187196 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Gm29354-201ENSMUST00000187613 696 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Gm37322-201ENSMUST00000193409 337 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Ltf-209ENSMUST00000198884 616 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Gm43786-202ENSMUST00000202157 616 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Gm44147-201ENSMUST00000204658 94 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Gm44112-201ENSMUST00000204787 372 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Gm44621-201ENSMUST00000207643 1166 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 AC154904.1-201ENSMUST00000219510 312 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 D830013O20Rik-202ENSMUST00000221180 683 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Diaph3-204ENSMUST00000226254 682 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Rhox4e-201ENSMUST00000089075 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Gm38009-201ENSMUST00000194884 3341 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Usp37-205ENSMUST00000189257 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Bdnf-211ENSMUST00000176893 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Olfr161-202ENSMUST00000216259 7133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Dnajc6-203ENSMUST00000106929 5128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Frmd4b-204ENSMUST00000113359 4311 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Plekha6-202ENSMUST00000105082 7085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Tirap-201ENSMUST00000175765 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Ank3-210ENSMUST00000182155 6375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Mfap1b-201ENSMUST00000056732 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Btnl10-202ENSMUST00000069941 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Atrx-201ENSMUST00000101305 2903 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Smad5-201ENSMUST00000069557 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Ubr5-204ENSMUST00000226414 8397 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Vwde-201ENSMUST00000054530 3979 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Gm8279-202ENSMUST00000165713 1760 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Gm5795-203ENSMUST00000171150 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Adgrl2-204ENSMUST00000195988 4541 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Gm6567-201ENSMUST00000205529 2095 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprsB0V2N1 Ctnnd1-207ENSMUST00000111676 5852 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.3 ms