Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Gm27231-201ENSMUST00000185191 551 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Gm37439-201ENSMUST00000193150 856 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Gm45307-201ENSMUST00000211122 751 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Il20-201ENSMUST00000027673 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Commd8-201ENSMUST00000013693 3895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Gigyf2-217ENSMUST00000174501 3876 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Vmn1r199-203ENSMUST00000227689 5537 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Olfr259-202ENSMUST00000213978 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Spin4-201ENSMUST00000096367 4173 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Rab7b-202ENSMUST00000064679 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Epas1-201ENSMUST00000024954 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Gm43292-201ENSMUST00000199580 2449 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 CT009604.1-201ENSMUST00000223900 1328 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Nup188-201ENSMUST00000064447 5710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Crb1-201ENSMUST00000059825 5901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Olfr60-203ENSMUST00000211031 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Olfr60-204ENSMUST00000215023 2692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Gm37739-201ENSMUST00000191742 1505 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Tssk1-201ENSMUST00000046937 3700 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Ccdc47-202ENSMUST00000106865 704 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Gm14893-201ENSMUST00000117904 282 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Gm15568-201ENSMUST00000118589 1213 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Gm14466-201ENSMUST00000119028 451 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Gm11796-201ENSMUST00000120208 972 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Gm15242-201ENSMUST00000122459 283 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Col6a5-201ENSMUST00000165165 8046 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Gm44471-201ENSMUST00000197963 100 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Gm45267-201ENSMUST00000211028 522 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Reep3-202ENSMUST00000217841 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 4930455C13Rik-201ENSMUST00000218108 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 AC122533.1-201ENSMUST00000225177 767 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Olfr401-201ENSMUST00000079827 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Rai14-201ENSMUST00000090339 4909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Adcy9-202ENSMUST00000117801 4507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Cphx1-204ENSMUST00000184016 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 AC130831.1-201ENSMUST00000224546 1474 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Gm4927-201ENSMUST00000219548 1318 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Fam193a-201ENSMUST00000094867 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Dapp1-201ENSMUST00000029806 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Itgam-205ENSMUST00000120355 3701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Abcc3-206ENSMUST00000178136 5005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Chil3-201ENSMUST00000063062 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Rel-201ENSMUST00000102864 7466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Rad51b-203ENSMUST00000218039 2187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Zfp551-201ENSMUST00000080348 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Sycp1-201ENSMUST00000029448 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Gm29571-201ENSMUST00000191547 1909 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Erbb4-202ENSMUST00000121473 12037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Gm43970-201ENSMUST00000204346 3605 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Rnf144b-202ENSMUST00000110111 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Ppfia1-202ENSMUST00000182226 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Dclk1-212ENSMUST00000199585 5196 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Gm13732-201ENSMUST00000117753 535 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Gm12101-201ENSMUST00000121590 390 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 2210411M09Rik-201ENSMUST00000128545 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Gm11335-201ENSMUST00000148743 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Gm3373-201ENSMUST00000169087 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Gm7426-201ENSMUST00000179046 404 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Gm8192-201ENSMUST00000182196 958 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Gm27602-201ENSMUST00000183861 111 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Gm43748-201ENSMUST00000202329 1233 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Gm31897-202ENSMUST00000206231 604 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Gm33586-201ENSMUST00000210768 892 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 D830013O20Rik-202ENSMUST00000221180 683 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Gm10354-201ENSMUST00000096953 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Vmn2r12-201ENSMUST00000095922 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Pum1-203ENSMUST00000097864 4017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Stil-201ENSMUST00000030490 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Stk26-202ENSMUST00000114887 3173 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Ppp4r4-202ENSMUST00000187155 2675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Gm18305-201ENSMUST00000216532 2128 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Gm11639-201ENSMUST00000148007 3613 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Dcdc5-201ENSMUST00000037284 3093 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Gm7694-201ENSMUST00000179801 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Flii-201ENSMUST00000002889 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Usp28-203ENSMUST00000213874 4109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Sf3b1-201ENSMUST00000027127 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Gm8281-201ENSMUST00000100893 612 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Gm14729-201ENSMUST00000118373 689 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Gm12844-201ENSMUST00000119463 582 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Gm16157-202ENSMUST00000135564 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 G930045G22Rik-202ENSMUST00000161723 673 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Gm8237-202ENSMUST00000178594 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Gm42580-201ENSMUST00000197223 753 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Gm3511-201ENSMUST00000199823 204 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Gm44386-201ENSMUST00000204288 429 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 BC024386-204ENSMUST00000209842 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 AC166078.1-201ENSMUST00000217211 584 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Gm19340-201ENSMUST00000221995 345 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 CT009711.2-201ENSMUST00000225352 934 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Dpm2-201ENSMUST00000028151 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prdm2A2A7B5 Gm21731-201ENSMUST00000079524 489 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms