Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrit3W8DXL4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrit3W8DXL4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrit3W8DXL4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrit3W8DXL4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrit3W8DXL4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrit3W8DXL4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrit3W8DXL4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrit3W8DXL4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrit3W8DXL4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrit3W8DXL4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrit3W8DXL4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrit3W8DXL4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrit3W8DXL4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms