Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3550W4VSN7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms