Protein–RNA interactions for Protein: V9GX34

Csmd2, CUB and Sushi multiple domains 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd2V9GX34 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csmd2V9GX34 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
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