Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z331

Krt6b, Keratin, type II cytoskeletal 6B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6bQ9Z331 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt6bQ9Z331 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt6bQ9Z331 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt6bQ9Z331 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt6bQ9Z331 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt6bQ9Z331 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt6bQ9Z331 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt6bQ9Z331 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt6bQ9Z331 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt6bQ9Z331 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt6bQ9Z331 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt6bQ9Z331 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt6bQ9Z331 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt6bQ9Z331 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt6bQ9Z331 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt6bQ9Z331 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt6bQ9Z331 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt6bQ9Z331 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt6bQ9Z331 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt6bQ9Z331 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt6bQ9Z331 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt6bQ9Z331 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms