Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Top3bQ9Z321 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Top3bQ9Z321 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Top3bQ9Z321 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Top3bQ9Z321 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Top3bQ9Z321 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Top3bQ9Z321 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Top3bQ9Z321 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Top3bQ9Z321 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Top3bQ9Z321 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Top3bQ9Z321 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms