Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Crlf3Q9Z2L7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Crlf3Q9Z2L7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms