Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I4

Robo3, Roundabout homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo3Q9Z2I4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms