Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C4

Mtmr1, Myotubularin-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr1Q9Z2C4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mtmr1Q9Z2C4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mtmr1Q9Z2C4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mtmr1Q9Z2C4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mtmr1Q9Z2C4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mtmr1Q9Z2C4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mtmr1Q9Z2C4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mtmr1Q9Z2C4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mtmr1Q9Z2C4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mtmr1Q9Z2C4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mtmr1Q9Z2C4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mtmr1Q9Z2C4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mtmr1Q9Z2C4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mtmr1Q9Z2C4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mtmr1Q9Z2C4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Mtmr1Q9Z2C4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Mtmr1Q9Z2C4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mtmr1Q9Z2C4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mtmr1Q9Z2C4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mtmr1Q9Z2C4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mtmr1Q9Z2C4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mtmr1Q9Z2C4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Mtmr1Q9Z2C4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mtmr1Q9Z2C4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mtmr1Q9Z2C4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mtmr1Q9Z2C4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mtmr1Q9Z2C4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mtmr1Q9Z2C4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mtmr1Q9Z2C4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mtmr1Q9Z2C4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mtmr1Q9Z2C4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mtmr1Q9Z2C4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mtmr1Q9Z2C4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mtmr1Q9Z2C4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mtmr1Q9Z2C4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mtmr1Q9Z2C4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mtmr1Q9Z2C4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mtmr1Q9Z2C4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mtmr1Q9Z2C4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms