Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccne2Q9Z238 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccne2Q9Z238 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccne2Q9Z238 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccne2Q9Z238 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccne2Q9Z238 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccne2Q9Z238 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccne2Q9Z238 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccne2Q9Z238 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccne2Q9Z238 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccne2Q9Z238 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccne2Q9Z238 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccne2Q9Z238 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccne2Q9Z238 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccne2Q9Z238 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccne2Q9Z238 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccne2Q9Z238 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccne2Q9Z238 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccne2Q9Z238 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccne2Q9Z238 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccne2Q9Z238 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccne2Q9Z238 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccne2Q9Z238 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccne2Q9Z238 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccne2Q9Z238 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccne2Q9Z238 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccne2Q9Z238 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccne2Q9Z238 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccne2Q9Z238 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccne2Q9Z238 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccne2Q9Z238 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccne2Q9Z238 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccne2Q9Z238 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccne2Q9Z238 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccne2Q9Z238 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccne2Q9Z238 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccne2Q9Z238 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccne2Q9Z238 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccne2Q9Z238 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccne2Q9Z238 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccne2Q9Z238 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccne2Q9Z238 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccne2Q9Z238 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccne2Q9Z238 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccne2Q9Z238 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccne2Q9Z238 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccne2Q9Z238 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccne2Q9Z238 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccne2Q9Z238 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccne2Q9Z238 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccne2Q9Z238 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccne2Q9Z238 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccne2Q9Z238 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccne2Q9Z238 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccne2Q9Z238 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccne2Q9Z238 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccne2Q9Z238 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccne2Q9Z238 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccne2Q9Z238 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccne2Q9Z238 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccne2Q9Z238 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccne2Q9Z238 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccne2Q9Z238 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccne2Q9Z238 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccne2Q9Z238 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms