Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ap3b1Q9Z1T1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ap3b1Q9Z1T1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ap3b1Q9Z1T1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ap3b1Q9Z1T1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ap3b1Q9Z1T1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ap3b1Q9Z1T1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ap3b1Q9Z1T1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Ap3b1Q9Z1T1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ap3b1Q9Z1T1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ap3b1Q9Z1T1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ap3b1Q9Z1T1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ap3b1Q9Z1T1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ap3b1Q9Z1T1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ap3b1Q9Z1T1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ap3b1Q9Z1T1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Ap3b1Q9Z1T1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ap3b1Q9Z1T1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ap3b1Q9Z1T1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Ap3b1Q9Z1T1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Ap3b1Q9Z1T1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Ap3b1Q9Z1T1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ap3b1Q9Z1T1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ap3b1Q9Z1T1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Ap3b1Q9Z1T1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ap3b1Q9Z1T1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Ap3b1Q9Z1T1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Ap3b1Q9Z1T1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ap3b1Q9Z1T1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ap3b1Q9Z1T1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ap3b1Q9Z1T1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ap3b1Q9Z1T1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ap3b1Q9Z1T1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ap3b1Q9Z1T1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ap3b1Q9Z1T1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ap3b1Q9Z1T1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ap3b1Q9Z1T1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ap3b1Q9Z1T1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ap3b1Q9Z1T1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ap3b1Q9Z1T1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ap3b1Q9Z1T1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ap3b1Q9Z1T1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ap3b1Q9Z1T1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ap3b1Q9Z1T1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ap3b1Q9Z1T1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ap3b1Q9Z1T1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ap3b1Q9Z1T1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ap3b1Q9Z1T1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Ap3b1Q9Z1T1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ap3b1Q9Z1T1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ap3b1Q9Z1T1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ap3b1Q9Z1T1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ap3b1Q9Z1T1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ap3b1Q9Z1T1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ap3b1Q9Z1T1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ap3b1Q9Z1T1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ap3b1Q9Z1T1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ap3b1Q9Z1T1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ap3b1Q9Z1T1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ap3b1Q9Z1T1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ap3b1Q9Z1T1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ap3b1Q9Z1T1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ap3b1Q9Z1T1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ap3b1Q9Z1T1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ap3b1Q9Z1T1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ap3b1Q9Z1T1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ap3b1Q9Z1T1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ap3b1Q9Z1T1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ap3b1Q9Z1T1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ap3b1Q9Z1T1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Ap3b1Q9Z1T1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
Ap3b1Q9Z1T1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ap3b1Q9Z1T1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ap3b1Q9Z1T1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ap3b1Q9Z1T1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ap3b1Q9Z1T1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ap3b1Q9Z1T1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ap3b1Q9Z1T1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ap3b1Q9Z1T1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ap3b1Q9Z1T1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ap3b1Q9Z1T1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ap3b1Q9Z1T1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ap3b1Q9Z1T1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ap3b1Q9Z1T1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ap3b1Q9Z1T1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ap3b1Q9Z1T1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ap3b1Q9Z1T1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ap3b1Q9Z1T1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ap3b1Q9Z1T1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms