Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1R4

D17h6s53e, Uncharacterized protein C6orf47 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17h6s53eQ9Z1R4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms