Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddx39bQ9Z1N5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddx39bQ9Z1N5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms