Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z185

Padi1, Protein-arginine deiminase type-1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi1Q9Z185 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Padi1Q9Z185 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Padi1Q9Z185 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Padi1Q9Z185 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Padi1Q9Z185 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Padi1Q9Z185 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Padi1Q9Z185 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Padi1Q9Z185 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Padi1Q9Z185 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Padi1Q9Z185 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Padi1Q9Z185 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Padi1Q9Z185 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Padi1Q9Z185 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Padi1Q9Z185 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Padi1Q9Z185 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Padi1Q9Z185 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Padi1Q9Z185 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Padi1Q9Z185 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Padi1Q9Z185 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Padi1Q9Z185 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Padi1Q9Z185 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Padi1Q9Z185 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Padi1Q9Z185 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Padi1Q9Z185 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Padi1Q9Z185 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Padi1Q9Z185 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Padi1Q9Z185 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Padi1Q9Z185 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Padi1Q9Z185 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Padi1Q9Z185 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Padi1Q9Z185 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Padi1Q9Z185 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Padi1Q9Z185 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Padi1Q9Z185 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Padi1Q9Z185 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Padi1Q9Z185 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Padi1Q9Z185 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Padi1Q9Z185 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Padi1Q9Z185 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Padi1Q9Z185 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Padi1Q9Z185 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Padi1Q9Z185 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Padi1Q9Z185 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Padi1Q9Z185 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Padi1Q9Z185 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Padi1Q9Z185 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Padi1Q9Z185 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Padi1Q9Z185 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Padi1Q9Z185 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Padi1Q9Z185 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Padi1Q9Z185 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Padi1Q9Z185 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Padi1Q9Z185 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Padi1Q9Z185 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Padi1Q9Z185 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Padi1Q9Z185 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Padi1Q9Z185 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Padi1Q9Z185 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Padi1Q9Z185 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Padi1Q9Z185 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Padi1Q9Z185 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Padi1Q9Z185 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Padi1Q9Z185 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Padi1Q9Z185 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Padi1Q9Z185 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Padi1Q9Z185 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Padi1Q9Z185 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Padi1Q9Z185 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Padi1Q9Z185 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Padi1Q9Z185 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Padi1Q9Z185 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Padi1Q9Z185 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Padi1Q9Z185 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Padi1Q9Z185 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Padi1Q9Z185 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Padi1Q9Z185 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Padi1Q9Z185 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Padi1Q9Z185 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Padi1Q9Z185 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Padi1Q9Z185 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Padi1Q9Z185 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Padi1Q9Z185 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Padi1Q9Z185 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Padi1Q9Z185 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Padi1Q9Z185 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Padi1Q9Z185 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Padi1Q9Z185 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Padi1Q9Z185 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Padi1Q9Z185 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Padi1Q9Z185 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Padi1Q9Z185 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Padi1Q9Z185 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Padi1Q9Z185 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Padi1Q9Z185 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Padi1Q9Z185 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Padi1Q9Z185 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Padi1Q9Z185 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Padi1Q9Z185 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Padi1Q9Z185 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Padi1Q9Z185 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms