Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp18Q9WTV6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Usp18Q9WTV6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms