Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP3

Spdef, SAM pointed domain-containing Ets transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpdefQ9WTP3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SpdefQ9WTP3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SpdefQ9WTP3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SpdefQ9WTP3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SpdefQ9WTP3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SpdefQ9WTP3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SpdefQ9WTP3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SpdefQ9WTP3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SpdefQ9WTP3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SpdefQ9WTP3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SpdefQ9WTP3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SpdefQ9WTP3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SpdefQ9WTP3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SpdefQ9WTP3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SpdefQ9WTP3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SpdefQ9WTP3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SpdefQ9WTP3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SpdefQ9WTP3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SpdefQ9WTP3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SpdefQ9WTP3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SpdefQ9WTP3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SpdefQ9WTP3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SpdefQ9WTP3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SpdefQ9WTP3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SpdefQ9WTP3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SpdefQ9WTP3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SpdefQ9WTP3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SpdefQ9WTP3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SpdefQ9WTP3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SpdefQ9WTP3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SpdefQ9WTP3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SpdefQ9WTP3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SpdefQ9WTP3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SpdefQ9WTP3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SpdefQ9WTP3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SpdefQ9WTP3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SpdefQ9WTP3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SpdefQ9WTP3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SpdefQ9WTP3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SpdefQ9WTP3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SpdefQ9WTP3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SpdefQ9WTP3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SpdefQ9WTP3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SpdefQ9WTP3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SpdefQ9WTP3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SpdefQ9WTP3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SpdefQ9WTP3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms