Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Fam50bQ9WTJ8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fam50bQ9WTJ8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fam50bQ9WTJ8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fam50bQ9WTJ8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam50bQ9WTJ8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam50bQ9WTJ8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam50bQ9WTJ8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam50bQ9WTJ8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam50bQ9WTJ8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam50bQ9WTJ8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam50bQ9WTJ8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam50bQ9WTJ8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam50bQ9WTJ8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam50bQ9WTJ8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam50bQ9WTJ8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam50bQ9WTJ8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam50bQ9WTJ8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam50bQ9WTJ8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam50bQ9WTJ8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam50bQ9WTJ8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam50bQ9WTJ8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam50bQ9WTJ8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam50bQ9WTJ8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam50bQ9WTJ8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam50bQ9WTJ8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam50bQ9WTJ8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam50bQ9WTJ8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam50bQ9WTJ8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam50bQ9WTJ8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam50bQ9WTJ8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam50bQ9WTJ8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms