Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R0

Lhx6, LIM/homeobox protein Lhx6, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx6Q9R1R0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lhx6Q9R1R0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lhx6Q9R1R0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lhx6Q9R1R0 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lhx6Q9R1R0 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Lhx6Q9R1R0 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Lhx6Q9R1R0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lhx6Q9R1R0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lhx6Q9R1R0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lhx6Q9R1R0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lhx6Q9R1R0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lhx6Q9R1R0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lhx6Q9R1R0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Lhx6Q9R1R0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lhx6Q9R1R0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lhx6Q9R1R0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lhx6Q9R1R0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lhx6Q9R1R0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lhx6Q9R1R0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lhx6Q9R1R0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lhx6Q9R1R0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lhx6Q9R1R0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lhx6Q9R1R0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lhx6Q9R1R0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lhx6Q9R1R0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lhx6Q9R1R0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Lhx6Q9R1R0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lhx6Q9R1R0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lhx6Q9R1R0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lhx6Q9R1R0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lhx6Q9R1R0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhx6Q9R1R0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms