Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1C0

Taf7, Transcription initiation factor TFIID subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf7Q9R1C0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Taf7Q9R1C0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Taf7Q9R1C0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Taf7Q9R1C0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Taf7Q9R1C0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Taf7Q9R1C0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Taf7Q9R1C0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Taf7Q9R1C0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Taf7Q9R1C0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Taf7Q9R1C0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Taf7Q9R1C0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Taf7Q9R1C0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Taf7Q9R1C0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Taf7Q9R1C0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Taf7Q9R1C0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Taf7Q9R1C0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Taf7Q9R1C0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Taf7Q9R1C0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Taf7Q9R1C0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Taf7Q9R1C0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Taf7Q9R1C0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Taf7Q9R1C0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Taf7Q9R1C0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Taf7Q9R1C0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Taf7Q9R1C0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Taf7Q9R1C0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Taf7Q9R1C0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Taf7Q9R1C0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Taf7Q9R1C0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Taf7Q9R1C0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Taf7Q9R1C0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms