Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zeb2Q9R0G7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zeb2Q9R0G7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Zeb2Q9R0G7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Zeb2Q9R0G7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Zeb2Q9R0G7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zeb2Q9R0G7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zeb2Q9R0G7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Zeb2Q9R0G7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zeb2Q9R0G7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zeb2Q9R0G7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zeb2Q9R0G7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zeb2Q9R0G7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Zeb2Q9R0G7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zeb2Q9R0G7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zeb2Q9R0G7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zeb2Q9R0G7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zeb2Q9R0G7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zeb2Q9R0G7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zeb2Q9R0G7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zeb2Q9R0G7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zeb2Q9R0G7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Zeb2Q9R0G7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zeb2Q9R0G7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zeb2Q9R0G7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zeb2Q9R0G7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zeb2Q9R0G7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zeb2Q9R0G7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zeb2Q9R0G7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zeb2Q9R0G7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zeb2Q9R0G7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zeb2Q9R0G7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zeb2Q9R0G7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zeb2Q9R0G7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Zeb2Q9R0G7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Zeb2Q9R0G7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Zeb2Q9R0G7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zeb2Q9R0G7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zeb2Q9R0G7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zeb2Q9R0G7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zeb2Q9R0G7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zeb2Q9R0G7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zeb2Q9R0G7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zeb2Q9R0G7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zeb2Q9R0G7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zeb2Q9R0G7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zeb2Q9R0G7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zeb2Q9R0G7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Zeb2Q9R0G7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zeb2Q9R0G7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zeb2Q9R0G7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zeb2Q9R0G7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zeb2Q9R0G7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zeb2Q9R0G7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zeb2Q9R0G7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zeb2Q9R0G7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Zeb2Q9R0G7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zeb2Q9R0G7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zeb2Q9R0G7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zeb2Q9R0G7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Zeb2Q9R0G7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zeb2Q9R0G7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Zeb2Q9R0G7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zeb2Q9R0G7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zeb2Q9R0G7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Zeb2Q9R0G7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Zeb2Q9R0G7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zeb2Q9R0G7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Zeb2Q9R0G7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zeb2Q9R0G7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zeb2Q9R0G7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Zeb2Q9R0G7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zeb2Q9R0G7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zeb2Q9R0G7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zeb2Q9R0G7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zeb2Q9R0G7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zeb2Q9R0G7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zeb2Q9R0G7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zeb2Q9R0G7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zeb2Q9R0G7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zeb2Q9R0G7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zeb2Q9R0G7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zeb2Q9R0G7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zeb2Q9R0G7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Zeb2Q9R0G7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zeb2Q9R0G7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zeb2Q9R0G7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zeb2Q9R0G7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zeb2Q9R0G7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zeb2Q9R0G7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zeb2Q9R0G7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zeb2Q9R0G7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Zeb2Q9R0G7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zeb2Q9R0G7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zeb2Q9R0G7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zeb2Q9R0G7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zeb2Q9R0G7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zeb2Q9R0G7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zeb2Q9R0G7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zeb2Q9R0G7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms