Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Wdr54Q9R0D8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms