Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Lamc3Q9R0B6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Lamc3Q9R0B6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Lamc3Q9R0B6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.49
Lamc3Q9R0B6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Lamc3Q9R0B6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Lamc3Q9R0B6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Lamc3Q9R0B6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Lamc3Q9R0B6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Lamc3Q9R0B6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Lamc3Q9R0B6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Lamc3Q9R0B6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Lamc3Q9R0B6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Lamc3Q9R0B6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Lamc3Q9R0B6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Lamc3Q9R0B6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Lamc3Q9R0B6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Lamc3Q9R0B6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Lamc3Q9R0B6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Lamc3Q9R0B6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Lamc3Q9R0B6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Lamc3Q9R0B6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Lamc3Q9R0B6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Lamc3Q9R0B6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Lamc3Q9R0B6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Lamc3Q9R0B6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Lamc3Q9R0B6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Lamc3Q9R0B6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Lamc3Q9R0B6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Lamc3Q9R0B6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Lamc3Q9R0B6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Lamc3Q9R0B6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Lamc3Q9R0B6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Lamc3Q9R0B6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Lamc3Q9R0B6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Lamc3Q9R0B6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Lamc3Q9R0B6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Lamc3Q9R0B6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Lamc3Q9R0B6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Lamc3Q9R0B6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Lamc3Q9R0B6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Lamc3Q9R0B6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Lamc3Q9R0B6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Lamc3Q9R0B6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Lamc3Q9R0B6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Lamc3Q9R0B6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Lamc3Q9R0B6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Lamc3Q9R0B6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Lamc3Q9R0B6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Lamc3Q9R0B6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Lamc3Q9R0B6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Lamc3Q9R0B6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Lamc3Q9R0B6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Lamc3Q9R0B6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Lamc3Q9R0B6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Lamc3Q9R0B6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Lamc3Q9R0B6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
Lamc3Q9R0B6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
Lamc3Q9R0B6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Lamc3Q9R0B6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Lamc3Q9R0B6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Lamc3Q9R0B6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Lamc3Q9R0B6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Lamc3Q9R0B6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Lamc3Q9R0B6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Lamc3Q9R0B6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Lamc3Q9R0B6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Lamc3Q9R0B6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Lamc3Q9R0B6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Lamc3Q9R0B6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Lamc3Q9R0B6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Lamc3Q9R0B6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Lamc3Q9R0B6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Lamc3Q9R0B6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Lamc3Q9R0B6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Lamc3Q9R0B6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Lamc3Q9R0B6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Lamc3Q9R0B6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Lamc3Q9R0B6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Lamc3Q9R0B6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Lamc3Q9R0B6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Lamc3Q9R0B6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Lamc3Q9R0B6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Lamc3Q9R0B6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Lamc3Q9R0B6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Lamc3Q9R0B6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Lamc3Q9R0B6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Lamc3Q9R0B6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Lamc3Q9R0B6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Lamc3Q9R0B6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Lamc3Q9R0B6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Lamc3Q9R0B6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Lamc3Q9R0B6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Lamc3Q9R0B6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Lamc3Q9R0B6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Lamc3Q9R0B6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Lamc3Q9R0B6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Lamc3Q9R0B6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Lamc3Q9R0B6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Lamc3Q9R0B6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms