Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atp11cQ9QZW0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atp11cQ9QZW0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atp11cQ9QZW0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atp11cQ9QZW0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atp11cQ9QZW0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp11cQ9QZW0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp11cQ9QZW0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp11cQ9QZW0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp11cQ9QZW0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp11cQ9QZW0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp11cQ9QZW0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp11cQ9QZW0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp11cQ9QZW0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp11cQ9QZW0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp11cQ9QZW0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp11cQ9QZW0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms