Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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