Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChmlQ9QZD5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChmlQ9QZD5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ChmlQ9QZD5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChmlQ9QZD5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChmlQ9QZD5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChmlQ9QZD5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChmlQ9QZD5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChmlQ9QZD5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChmlQ9QZD5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChmlQ9QZD5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChmlQ9QZD5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ChmlQ9QZD5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ChmlQ9QZD5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChmlQ9QZD5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChmlQ9QZD5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChmlQ9QZD5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChmlQ9QZD5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChmlQ9QZD5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChmlQ9QZD5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChmlQ9QZD5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChmlQ9QZD5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChmlQ9QZD5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChmlQ9QZD5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChmlQ9QZD5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChmlQ9QZD5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChmlQ9QZD5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChmlQ9QZD5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChmlQ9QZD5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChmlQ9QZD5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChmlQ9QZD5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChmlQ9QZD5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChmlQ9QZD5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChmlQ9QZD5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChmlQ9QZD5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChmlQ9QZD5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChmlQ9QZD5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChmlQ9QZD5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChmlQ9QZD5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChmlQ9QZD5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChmlQ9QZD5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChmlQ9QZD5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChmlQ9QZD5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ChmlQ9QZD5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ChmlQ9QZD5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChmlQ9QZD5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChmlQ9QZD5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChmlQ9QZD5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChmlQ9QZD5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChmlQ9QZD5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChmlQ9QZD5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChmlQ9QZD5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChmlQ9QZD5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms