Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ubxn8Q9QZ49 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ubxn8Q9QZ49 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ubxn8Q9QZ49 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ubxn8Q9QZ49 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ubxn8Q9QZ49 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ubxn8Q9QZ49 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ubxn8Q9QZ49 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ubxn8Q9QZ49 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ubxn8Q9QZ49 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ubxn8Q9QZ49 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ubxn8Q9QZ49 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ubxn8Q9QZ49 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ubxn8Q9QZ49 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ubxn8Q9QZ49 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ubxn8Q9QZ49 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ubxn8Q9QZ49 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ubxn8Q9QZ49 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ubxn8Q9QZ49 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ubxn8Q9QZ49 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ubxn8Q9QZ49 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Ubxn8Q9QZ49 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ubxn8Q9QZ49 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ubxn8Q9QZ49 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ubxn8Q9QZ49 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ubxn8Q9QZ49 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ubxn8Q9QZ49 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ubxn8Q9QZ49 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ubxn8Q9QZ49 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms