Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYR7

Acot3, Acyl-coenzyme A thioesterase 3, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acot3Q9QYR7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acot3Q9QYR7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acot3Q9QYR7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acot3Q9QYR7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acot3Q9QYR7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acot3Q9QYR7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acot3Q9QYR7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acot3Q9QYR7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acot3Q9QYR7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acot3Q9QYR7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acot3Q9QYR7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acot3Q9QYR7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acot3Q9QYR7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acot3Q9QYR7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acot3Q9QYR7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acot3Q9QYR7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Acot3Q9QYR7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Acot3Q9QYR7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Acot3Q9QYR7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Acot3Q9QYR7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Acot3Q9QYR7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Acot3Q9QYR7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Acot3Q9QYR7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Acot3Q9QYR7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Acot3Q9QYR7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Acot3Q9QYR7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Acot3Q9QYR7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Acot3Q9QYR7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Acot3Q9QYR7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Acot3Q9QYR7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Acot3Q9QYR7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Acot3Q9QYR7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Acot3Q9QYR7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Acot3Q9QYR7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Acot3Q9QYR7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Acot3Q9QYR7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Acot3Q9QYR7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Acot3Q9QYR7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Acot3Q9QYR7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Acot3Q9QYR7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Acot3Q9QYR7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Acot3Q9QYR7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Acot3Q9QYR7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Acot3Q9QYR7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Acot3Q9QYR7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Acot3Q9QYR7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Acot3Q9QYR7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Acot3Q9QYR7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Acot3Q9QYR7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Acot3Q9QYR7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Acot3Q9QYR7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Acot3Q9QYR7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Acot3Q9QYR7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Acot3Q9QYR7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Acot3Q9QYR7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Acot3Q9QYR7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Acot3Q9QYR7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Acot3Q9QYR7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Acot3Q9QYR7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Acot3Q9QYR7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Acot3Q9QYR7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Acot3Q9QYR7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Acot3Q9QYR7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Acot3Q9QYR7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Acot3Q9QYR7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Acot3Q9QYR7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Acot3Q9QYR7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Acot3Q9QYR7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Acot3Q9QYR7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Acot3Q9QYR7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Acot3Q9QYR7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Acot3Q9QYR7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Acot3Q9QYR7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Acot3Q9QYR7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Acot3Q9QYR7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Acot3Q9QYR7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Acot3Q9QYR7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Acot3Q9QYR7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Acot3Q9QYR7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Acot3Q9QYR7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Acot3Q9QYR7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Acot3Q9QYR7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Acot3Q9QYR7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Acot3Q9QYR7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Acot3Q9QYR7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Acot3Q9QYR7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Acot3Q9QYR7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Acot3Q9QYR7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Acot3Q9QYR7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Acot3Q9QYR7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Acot3Q9QYR7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Acot3Q9QYR7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Acot3Q9QYR7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Acot3Q9QYR7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Acot3Q9QYR7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Acot3Q9QYR7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Acot3Q9QYR7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Acot3Q9QYR7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Acot3Q9QYR7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Acot3Q9QYR7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms