Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx4Q9QY61 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 313.4 ms