Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nr2e3Q9QXZ7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nr2e3Q9QXZ7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nr2e3Q9QXZ7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nr2e3Q9QXZ7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nr2e3Q9QXZ7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nr2e3Q9QXZ7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nr2e3Q9QXZ7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nr2e3Q9QXZ7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nr2e3Q9QXZ7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nr2e3Q9QXZ7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nr2e3Q9QXZ7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nr2e3Q9QXZ7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nr2e3Q9QXZ7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nr2e3Q9QXZ7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nr2e3Q9QXZ7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nr2e3Q9QXZ7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nr2e3Q9QXZ7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nr2e3Q9QXZ7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nr2e3Q9QXZ7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Nr2e3Q9QXZ7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Nr2e3Q9QXZ7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nr2e3Q9QXZ7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nr2e3Q9QXZ7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nr2e3Q9QXZ7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nr2e3Q9QXZ7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nr2e3Q9QXZ7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nr2e3Q9QXZ7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nr2e3Q9QXZ7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nr2e3Q9QXZ7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nr2e3Q9QXZ7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Nr2e3Q9QXZ7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nr2e3Q9QXZ7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nr2e3Q9QXZ7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nr2e3Q9QXZ7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nr2e3Q9QXZ7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nr2e3Q9QXZ7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nr2e3Q9QXZ7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nr2e3Q9QXZ7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nr2e3Q9QXZ7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nr2e3Q9QXZ7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nr2e3Q9QXZ7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nr2e3Q9QXZ7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nr2e3Q9QXZ7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nr2e3Q9QXZ7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nr2e3Q9QXZ7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nr2e3Q9QXZ7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nr2e3Q9QXZ7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nr2e3Q9QXZ7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nr2e3Q9QXZ7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nr2e3Q9QXZ7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nr2e3Q9QXZ7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nr2e3Q9QXZ7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nr2e3Q9QXZ7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nr2e3Q9QXZ7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nr2e3Q9QXZ7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nr2e3Q9QXZ7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nr2e3Q9QXZ7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nr2e3Q9QXZ7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nr2e3Q9QXZ7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Nr2e3Q9QXZ7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nr2e3Q9QXZ7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nr2e3Q9QXZ7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nr2e3Q9QXZ7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nr2e3Q9QXZ7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nr2e3Q9QXZ7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nr2e3Q9QXZ7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nr2e3Q9QXZ7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nr2e3Q9QXZ7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nr2e3Q9QXZ7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nr2e3Q9QXZ7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nr2e3Q9QXZ7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nr2e3Q9QXZ7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nr2e3Q9QXZ7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nr2e3Q9QXZ7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nr2e3Q9QXZ7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nr2e3Q9QXZ7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Nr2e3Q9QXZ7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nr2e3Q9QXZ7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nr2e3Q9QXZ7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nr2e3Q9QXZ7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nr2e3Q9QXZ7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Nr2e3Q9QXZ7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nr2e3Q9QXZ7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nr2e3Q9QXZ7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nr2e3Q9QXZ7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Nr2e3Q9QXZ7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nr2e3Q9QXZ7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nr2e3Q9QXZ7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nr2e3Q9QXZ7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nr2e3Q9QXZ7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nr2e3Q9QXZ7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nr2e3Q9QXZ7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nr2e3Q9QXZ7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Nr2e3Q9QXZ7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nr2e3Q9QXZ7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms