Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nufip1Q9QXX8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nufip1Q9QXX8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nufip1Q9QXX8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nufip1Q9QXX8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nufip1Q9QXX8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nufip1Q9QXX8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nufip1Q9QXX8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nufip1Q9QXX8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nufip1Q9QXX8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nufip1Q9QXX8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nufip1Q9QXX8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nufip1Q9QXX8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nufip1Q9QXX8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nufip1Q9QXX8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nufip1Q9QXX8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nufip1Q9QXX8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nufip1Q9QXX8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nufip1Q9QXX8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nufip1Q9QXX8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nufip1Q9QXX8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nufip1Q9QXX8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nufip1Q9QXX8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nufip1Q9QXX8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nufip1Q9QXX8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nufip1Q9QXX8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nufip1Q9QXX8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nufip1Q9QXX8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nufip1Q9QXX8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nufip1Q9QXX8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nufip1Q9QXX8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nufip1Q9QXX8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nufip1Q9QXX8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nufip1Q9QXX8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nufip1Q9QXX8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nufip1Q9QXX8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nufip1Q9QXX8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nufip1Q9QXX8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nufip1Q9QXX8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nufip1Q9QXX8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nufip1Q9QXX8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nufip1Q9QXX8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nufip1Q9QXX8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nufip1Q9QXX8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nufip1Q9QXX8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nufip1Q9QXX8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nufip1Q9QXX8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nufip1Q9QXX8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nufip1Q9QXX8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nufip1Q9QXX8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nufip1Q9QXX8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nufip1Q9QXX8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nufip1Q9QXX8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nufip1Q9QXX8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nufip1Q9QXX8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nufip1Q9QXX8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nufip1Q9QXX8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nufip1Q9QXX8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms