Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms