Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rai2Q9QVY8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms