Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrfQ9JM73 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrfQ9JM73 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrfQ9JM73 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrfQ9JM73 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrfQ9JM73 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrfQ9JM73 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrfQ9JM73 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrfQ9JM73 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrfQ9JM73 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrfQ9JM73 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrfQ9JM73 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrfQ9JM73 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SrfQ9JM73 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrfQ9JM73 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrfQ9JM73 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrfQ9JM73 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrfQ9JM73 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrfQ9JM73 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrfQ9JM73 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrfQ9JM73 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrfQ9JM73 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrfQ9JM73 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrfQ9JM73 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrfQ9JM73 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrfQ9JM73 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrfQ9JM73 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrfQ9JM73 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrfQ9JM73 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrfQ9JM73 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrfQ9JM73 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrfQ9JM73 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrfQ9JM73 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrfQ9JM73 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrfQ9JM73 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SrfQ9JM73 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrfQ9JM73 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrfQ9JM73 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrfQ9JM73 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrfQ9JM73 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrfQ9JM73 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrfQ9JM73 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms