Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM62

Reep6, Receptor expression-enhancing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep6Q9JM62 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Reep6Q9JM62 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Reep6Q9JM62 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Reep6Q9JM62 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Reep6Q9JM62 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms