Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ldb3Q9JKS4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms