Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms