Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nectin1Q9JKF6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms