Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms