Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trem3Q9JKE1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trem3Q9JKE1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trem3Q9JKE1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trem3Q9JKE1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trem3Q9JKE1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trem3Q9JKE1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trem3Q9JKE1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trem3Q9JKE1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trem3Q9JKE1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trem3Q9JKE1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trem3Q9JKE1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trem3Q9JKE1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trem3Q9JKE1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trem3Q9JKE1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trem3Q9JKE1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms