Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scamp5Q9JKD3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Scamp5Q9JKD3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scamp5Q9JKD3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scamp5Q9JKD3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scamp5Q9JKD3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scamp5Q9JKD3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scamp5Q9JKD3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scamp5Q9JKD3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scamp5Q9JKD3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scamp5Q9JKD3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scamp5Q9JKD3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scamp5Q9JKD3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scamp5Q9JKD3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scamp5Q9JKD3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scamp5Q9JKD3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scamp5Q9JKD3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Scamp5Q9JKD3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scamp5Q9JKD3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scamp5Q9JKD3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Scamp5Q9JKD3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scamp5Q9JKD3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scamp5Q9JKD3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scamp5Q9JKD3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scamp5Q9JKD3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scamp5Q9JKD3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scamp5Q9JKD3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scamp5Q9JKD3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scamp5Q9JKD3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Scamp5Q9JKD3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scamp5Q9JKD3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scamp5Q9JKD3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scamp5Q9JKD3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scamp5Q9JKD3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scamp5Q9JKD3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scamp5Q9JKD3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Scamp5Q9JKD3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Scamp5Q9JKD3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scamp5Q9JKD3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scamp5Q9JKD3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scamp5Q9JKD3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scamp5Q9JKD3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scamp5Q9JKD3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scamp5Q9JKD3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scamp5Q9JKD3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scamp5Q9JKD3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scamp5Q9JKD3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scamp5Q9JKD3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scamp5Q9JKD3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scamp5Q9JKD3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scamp5Q9JKD3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scamp5Q9JKD3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scamp5Q9JKD3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scamp5Q9JKD3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scamp5Q9JKD3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scamp5Q9JKD3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scamp5Q9JKD3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scamp5Q9JKD3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scamp5Q9JKD3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scamp5Q9JKD3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Scamp5Q9JKD3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Scamp5Q9JKD3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms